二者核心区别在于产权归属。出租只是获得短期使用权，厂房所有权仍归原房主，租期最长20年，到期需续租或搬离。前期投入低，只需缴纳押金和按月付租金，但不能随意改建、抵押、买卖，拆迁补偿也归房东。
厂房转让本质是买卖（出售），完成过户后，房屋产权、土地使用权彻底转移，你成为合法产权人。可自由改造、转租、抵押，买卖，也能享受房产增值与拆迁收益，长期使用无到期困扰。不过前期资金压力大，需要一次性支付大额款项。
一句话总结：短期经营、资金有限选出租；长期发展、想持有固定资产并享受增值收益，优先考虑转让。